Y llegó la inundación... Y Sentinel 2

Este va a ser mi primer, y supongo que último, post como "infiltrado" del LAST, ya que el día 30 de noviembre finalizó mi contrato.
Mi primer post en este blog fue "Y llegó la inundación", así que me parecía un modo redondo de acabar mis posts con otro "Y llegó la inundación (y se va el que suscribe...)".  Pero ha coincidido mi marcha con la esperada salida de las imágenes Sentinel-2A, así que en este post voy a tratar de mezclar ambas informaciones.

    Y llegó la inundación:

La precipitación acumulada a finales de noviembre era de 170 mm (media para las estaciones del IFAPA de Sanlúcar, Moguer, Almonte y Aznalcazar), la media de la serie histórica (período  1970/2010) es de 168 mm a finales de noviembre. Estamos por tanto de momento, en un año hidrológico medio. Sin embargo sorprende la concentración de esas precipitaciones, que en su mayor parte (140 mm de los 170 mm) cayeron en 2 semanas: del 10 al 18 de octubre y del 26 de octubre al 2 de noviembre. El 18 de octubre y el 2 de noviembre se superaron los 30 mm. Noviembre de hecho, empezó muy lluvioso, ya que el día 1 cayeron 20,5 mm de media en las estaciones analizadas. En total durante los 2 primeros días de noviembre se recogieron 51.5 mm ...Y ya no ha vuelto a llover.

La media de noviembre en la serie histórica es de 79 mm, por lo que noviembre ha estado por debajo de la media y diciembre, que es tradicionalmente el mes más lluvioso (100 mm de media en la serie histórica), va camino de ser bastante seco. A día 10 no ha llovido nada y la previsión para los próximos 7 días es que continúe sin llover.

En cualquier caso, la concentración de esos 170 mm en las últimas 2 semanas de octubre y los primeros días de noviembre, hizo que comenzaran a correr los arroyos (fundamentalmente La Rocina, parece que no El Guadiamar no llegó a entrar por El Travieso) vertientes a la marisma, y que se llenaran por precipitación directa los lucios y zonas bajas de la marisma.
El día 11 de noviembre hubo un paso del satélite Landsat 7 que tomó esta magnífica imagen:

Se aprecia perfectamente como el agua va bajando desde la madre y como han cogido algo de agua los lucios del Membrillo, Ánsares, Marilópez, El Lobo, El Caballero, Lucio Largo...

Al ser noviembre un mes tan seco hemos tenido varias Landast disponibles, aquí podéis verlas todas en detalle. Lo que se aprecia es la entrada lenta de La Rocina en la marisma, y como el agua va fluyendo lentamente hacia el sur, "derramándose" por las zonas más bajas en su búsqueda de la desembocadura.

A continuación se muestra una comparativa de la escena de la situación de la marisma ya mostrada (19 de noviembre) con la Landsat 8 del 5 de diciembre. (recomendación personal es verla en este link mejor que aquí incrustada. Si os da pereza abrir el link al menos darle a "Ocultar Información" que por defecto aparece muy grande)

    Y llegó Sentinel 2:

Por fin contamos con la primera escena Sentinel 2 de Doñana. Ya hablamos en un post anterior del lanzamiento de este satélite , que está llamado a convertirse en un protagonista importante del mundo de la teledetección en los próximos años.
La escena se tomó además el día 29 de noviembre, por lo que contamos con una fecha intermedia, para ver como ha sido la evolución en la inundación de la marisma, durante el período visto con Landsat (19/11/15-05/12/15). Esto será la tónica habitual a partir de ahora, ya que la resolución temporal de Sentinel 2 es de 10 días, de modo que en un mes medio tendremos 2 imágenes Landsat 8, 2 Landsat 7 y 3 Sentinel 2. Esto ya de por sí se podría calificar de "alucinante", pero lo mejor es que el año con el lanzamiento del Sentinel 2B habrá una imagen Sentinel 2 cada 5 días, con lo que en teoría habrá 10 imágenes mensuales.

Además de la mayor resolución temporal, Sentinel 2 cuenta con la ventaja de una mayor resolución espacial. Conando con bandas de 10 m, 20 m y 60 m de pixel. Es posible hacer NDVI a 10 m y máscaras de inundación a 20 m, lo que supone que pasamos de tener 900 m2 en un pixel, a tener 100 m2 y 400 m2 respectivamente.
A escalas de 1:50000 o inferiores, el cambio no es tan drástico:

Pero cuando la escala va siendo mayor, el cambio es notorio:

1) Vista de Matalascañas y Sana Olalla (arriba Landsat 8 y abajo Sentinel 2):

2) Vista del Membrillo y Salinas de San Diego:

3) Lucio del Caballero, Caño de La Junquera:

4) Lucio de Marilópez, Rabizón del Veladero y Caño del Guadiamar:

Para terminar, aquí podéis ver la escena Sentinel 2 con más detalle (zona sur de Doñana):

Estrenamos web del LAST

El Laboratorio estrena web. Dentro de la web de la Estación Biológica de Doñana tenéis acceso a las webs de los distintos laboratorios del centro. Podéis acceder a nuestra web directamente en el siguiente link:

http://www.ebd.csic.es/web/last/inicio

Desde allí podéis consultar los servicios que ofrecemos al centro, visitar virtualmente nuestras instalaciones y acceder a las noticias más interesantes relacionadas con nuestro trabajo. Además tenéis acceso directo a los Servidores de cartografía digital que actualmente gestiona el laboratorio (imágenes Landsat y productos derivados de Doñana, cartografía digital de seguimiento del Espacio Natural de Doñana y SPIDER, para la consulta temporal de imágenes Landsat de Doñana y la visualización de las campañas con sensores multiespectrales sobre el Espacio Natural). También iremos recopilando enlaces útiles para todos aquéllos que utilizais imágenes de sensores remotos. Esperamos vuestras sugerencias.

Contracts at Doñana Biological Station within ECOPOTENTIAL project

The Doñana Biological Station (CSIC) is participating in H2020 RIA project ECOPOTENTIAL. Within this framework we are looking for two candidates for two-year contracts starting in 2016.

ECOPOTENTIAL: IMPROVING FUTURE ECOSYSTEM BENEFITS THROUGH EARTH OBSERVATIONS

Project Summary:

Terrestrial and marine ecosystems provide essential services to human societies. Anthropogenic pressure, however, causes serious threat to ecosystems, leading to habitat degradation, “novel ecosystems” and increased risk of collapse, with related loss of ecosystem services. Knowledge-based conservation, management and restoration policies are needed, in order to improve ecosystem benefits in face of increasing pressures. ECOPOTENTIAL will make significant progress beyond the current state-of-the-art and create a new unified framework for ecosystem studies and management of protected areas (PA). ECOPOTENTIAL will focus on internationally recognized PAs in Europe and beyond; most PAs are UNESCO World Natural Heritage Sites, Biosphere Reserves, national parks and Natura 2000 sites. LTER sites and Large Marine Ecosystems are included. Best use of Earth Observation (EO) and monitoring data will be made possible by new EO ecosystem data services (ECOpernicus). New modelling approaches able to include information from EO data will be developed, ecosystem services in current and future conditions will be assessed, and the requirements of future protected areas will be defined. Open and interoperable access to data and knowledge will be assured by a GEO Ecosystem Virtual Laboratory Platform, fully integrated in GEOSS. Support to transparent and knowledge-based conservation and management policies, able to include information from EO data, will be given. Knowledge gained in the PAs will be upscaled to pan-European conditions and used for planning and management of future PAs. A permanent stakeholder consultancy group (GEO Ecosystem Community of Practice) will be created. Capacity building will be pursued at all levels. SMEs will be involved to create expertise leading to new job opportunities, ensuring commercial uptake and long-term continuation of services. In summary, ECOPOTENTIAL will use the most advanced technologies to improve future ecosystem benefits for humankind.

More information on ECOPOTENTIAL can be found in the project webpage:

    http://www.ecopotential-project.eu/


Candidate 1: Will work in Workpackages (WP) 4 "Earth Observation Data Quality & Services" and 6 "Ecosystem Modelling and Scenarios" coordinating Doñana Biological Station contribution to these workpackages.


The main aim of this position: To analyse temporal dynamics of wetlands in Doñana National Park using historical remote sensing data sets (Landsat, MODIS, Sentinel) and potentially in other PAs with similar wetlands (Camarge, Danube Delta) and build predictive models of ecosystem functions and services.

Expertise: The desired candidate should have experience in some or all of the following areas: Analysis of remote sensing data, especially satellite time-series. Remote sensing software. Time series statistical analysis. Statistical models in ecology. Species distribution models (Generalized Linear Models, Generalized Additive Models, Regression Trees, Neural Networks, Maximum Entropy Models). Computer programming.


Candidate 2: Will work in Workpackages (WP) 5 "In-situ monitoring data" and WP 11 "Policy development", coordinating Doñana Biological Station contribution to these workpackages.


The main aim of this position: To provide access to existing in-situ monitoring data for Doñana National Park to other members of the consortium. Coordinate ground-truthing of remote sensing derived land-use/land-cover maps, ecosystem function and ecosystem services model maps for Doñana wetlands. Organize the workshops defined within WP 11 with stakeholders for Doñana PA. The aim will be to define managers requirements and policy makers information needs for the conservation of Doñana National Park, enhance the use of EO and in-situ data in decision making, and show the potential of the specific modelling tools developed within ECOPOTENTIAL to park managers.

Expertise: The desired candidate should have experience in some or all of the following areas: Field sampling in ecology. Metadata of ecological datasets. Database management. Wetland ecology. Ecological modelling. Ecosystem services. Adaptive management and governance. Socio-ecosystems.


Both junior and senior post-doctoral candidates with a solid publication record related to the positions offered are encouraged to apply.


Starting date: January 2016 approx.
Salary: 35,000 € approx. per yr. before taxes


LAST INFO!

These positions have oficially been open as contracts:

OFICIAL ANNOUNCEMENT:

https://drive.google.com/open?id=0B6-ZAxoyUieVbHA5QXpzdjR5Qm8


APPLICATION FORM:
https://drive.google.com/open?id=0B6-ZAxoyUieVRVB4d0M3NjlWSGc

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This project has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No 641762
 

#AET2015 y #RSCW2015 ¿Qué fue del XVI congreso de la AET y del Wetland Symposium?

Finalmente tanto el XVI Congreso de la AET,  titulado Teledetección: Humedales y Espacio Protegidos, como el primer simposio internación bajo
el lema "What can Remote Sensing do for the Conservation of Wetlands?" tuvieron lugar.

Más de 200 participantes se reunieron del 21 al 23 de octubre en Sevilla para hablar de teledetección y de como estas herramientas pueden ayudar en conservación y gestión. Se habló de agricultura, de bosques, de incendios, de geología, de oceanografía... y también desde la perspectiva de los sensores, LiDAR, Hiperespectral, SAR o de las nuevas plataformas como los UAVs.

Hubo algunas novedades como la edición de las actas en formato libro electrónico, la celebración de un simposio internacional dentro del congreso, y la preparación de un Special Issue para la revista Remote Sensing. He reunido en Storify como se habló de los eventos en Twitter. Lo podéis ver siguiendo el enlace anterior.

También la prensa se hizo eco del evento. Especialmente de la inauguración en la calle de una exposición divulgativa de teledetección patrocinada por la Conserjería de Medio Ambiente y Ordenación del Territorio. La tenéis abierta hasta el 30 de octubre, así que debéis aprovechar si es que aún no la habéis visto.

Aquí más abajo podéis encontrar algunos enlaces hablando de la exposición en internet o en la prensa:

Web de la Consejería de Medio Ambiente

Prensa

2 de octubre de 2015, una Landsat muy especial

El pasado viernes 2 de octubre el satélite Landsat 8 capturó esta imagen:

En principio no se trata de una imagen que nos muestre nada extraño, más bien es una imagen que podríamos calificar de fea o mala, dada la nubosidad y bruma que hay en ella. Tampoco nos muestra un llenado temprano de la marisma ni nada por el estilo. Ni siquiera es la primera Landsat 8 que mostramos en el blog.

Lo que tiene esta imagen de especial, es que se trata de la primera imagen Landsat 8 normalizada con el nuevo protocolo automático del LAST!! (corriendo además (este es un apunte interno, perdón) desde la maquina virtual).
Realmente antes de esta escena se han normalizado 2 veces todas las Landsat 8, pero bien por lo que podríamos calificar como "quisquillosidad davidiana" o bien por pura incompetencia mía, siempre quedaba algún fleco que recortar.

En principio y cruzando los dedos, ya estaría todo terminado e instalado donde tiene que estar. Previsiblemente a lo largo de esta semana se irán subiendo todas las Landsat 8 a los servidores de cartografía, y/o estarán disponibles a través del LAST.

Este protocolo es la automatización del protocolo anterior, está realizado en python, usando GDAL y Rasterio como librerías principales. El único software que se sigue utilizando es  Miramón, al que se llama desde el código a través de archivos '.bat'.

El proceso anterior requería de un técnico trabajando entre 1'5 y 3 horas para hacer una escena. Ahora en la maquina virtual (que va algo lenta, a ver si algún compañero de informática lee esto y nos la amplía un poco) el proceso tarda unos 30 minutos, dejando al técnico libre para tomar café, charlar con los compañeros, pasear por la EBD y alrededores,  o incluso en casos extremos, trabajar en otra cosa.

Bueno, revisando un poco la imagen, parece que sí hay algo que llama la atención, y es la cantidad de incendios que se ven en los arrozales de Isla Mayor. En esta composición (R. 7,G: 3,B: 2) se ven muy bien:

Seguramente en unas semanas haya más novedades respecto a Landsat 8 (Y Sentinel 2A, que las imágenes deben de estar al caer!)

Saludos a todos

Pd. Haciendo click en la imagen podeís navegar por la escena.